关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题

关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题,第1张

ncbi主页 进入 blast 进入 nucleotide blast 将序列粘入窗口中 选择nucleotide cllection(nr/nt)选项 进行比对就可以了 出来的序列相似性最高的就是你的目的序列

基于云计算的解决方案:

1 blast2 (http://blastncbinlmnihgov/BlastcgiPAGE_TYPE=BlastSearch&PROG_DEF=blastn&BLAST_PROG_DEF=megaBlast&BLAST_SPEC=blast2seq)分析了你的序列,完全匹配的序列比例比较低。完全匹配区对应第一条序列425到865碱基。你在做PCR时使用了高保真酶吗?如果没有这个结果比较合理。

2提取完全匹配序列 截断序列(425-865),重复blast2分析。这一步,序列应该是100%匹配。如果不是,序列起始或终止位点有问题。检查后,在结果页面 下载blast2的xml文件拷贝序列。

3 用这条序列做blast。下面是物种报告。可以肯定的是你的细菌来自Firmicutes门。其他的就不能肯定了,应为所有的匹配序列都是100%匹配你的最佳测序区段。个人感觉你的测序结果还有很大的提升空间,应该在实验上在下下功夫。

Taxonomy Report

Bacteria 100 hits 4 orgs [root; cellular organisms]

Firmicutes 15 hits 3 orgs

Lactobacillus 3 hits 2 orgs [Bacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae]

Lactobacillus murinus 1 hits 1 orgs

Lactobacillus animalis 2 hits 1 orgs

uncultured Firmicutes bacterium 12 hits 1 orgs [environmental samples]

uncultured bacterium 85 hits 1 orgs [environmental samples]

下面是瞎猜的: 你的细菌有90%的可能性是革兰氏阳性菌,而且是低GC含量,有可能是一种工业用菌,例如酿酒。^_^

首先项链可以采用焊接的方法进行修复,如果有缺失的部分就需要寻找相同的材质将其焊接上去,普通项链的话,焊接可以到五金店铺进行修复,不过对于卡地亚项链这种贵重的奢侈品,我们还是建议到售后或者专业的奢饰品服务中心。

其实项链多是金属材质,项链断了以后,如果你找专业的维修机构来修的话,专业的珠宝维修师通过焊接抛光,可以很好地修复项链。如果项链断裂的比较严重,专业的珠宝维修师还会根据需求定制合适的配件更换,也能起到非常不错的修复效果。

其实相对于这种贵重的奢侈品来说,自己焊接的这种方法的万万不可取的,一定要记得找专业的维修中心来进行修复,一旦自己在家修复损坏的可能就是一条贵重项链了。

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