萜类和聚酮化合物的代谢通路的意义在植物防御系统中起到关键作用。根据相关公开信息查询显示萜类可保护植物细胞膜、产生多种内源激素、保护植物免受强光的伤害、萜类中的信号物质和化感物质在植物防御系统中起到关键作用。萜类化合物是所有异戊二烯聚合物及其衍生物的总称,萜类化合物中的烃类物质通常称为萜烯。萜类化合物除了以萜稀类和甾类的形式存在外,还以各种含氧衍生物的形式存在,包括醇、醛、羧酸、酮、酯类、苷等。而脂类代谢、异生素生物降解和代谢、氨基酸代谢、萜类化合物和聚酮化合物的代谢以及其他次生代谢产物的生物合成的功能基因在LH系统中明显偏高。
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