群体遗传分析方法：LD,FST,eQTL

LD(连锁不平衡):计算使用plink,

FST(遗传分化指数):计算使用vcftools,可视化分为箱线图和散点图，单组比较使用在染色体上的散点图，多组比较使用箱线图。

FST的原理，计算方法，可视化的方法 https://wwwjianshucom/p/bb0beec0ed63

haploPS和XP-EHH

平均测序深度：

等位基因频率：

vcftools使用说明：1 https://wwwdazhuanlancom/2020/03/04/5e5f850672ddf/

Fst值的取值范围是[0,1]，最大值为1表明两个群体完全分化，最小值为0表明群体间无分化。

实际使用FST<0--005,表示群体分化很小；005--015，中等程度的分化；015--025，较大的分化；025以上，分化很大。

其实Fst分析就是看两个群体之间分化程度的一种方法，Fst值越大（越接近1）表明两个群体间分化程度越高，亲缘关系越远；Fst值越小（越接近0）表明群体间分化程度越低，亲缘关系越近。

分为按照 SNP单点计算 和 滑动窗口模式计算 ，一般使用的是滑动窗模式

####### SNP单点计算

参数说明：

--vcf 输入vcf文件

--weir-fst-pop 输入群体的群体ID名，该文件必须是txt格式，每个ID占一行。

--fst-window-size 500000 --fst-window-step 50000 ，这里窗口设置为500kb，步长设置为50kb。根据情况调整窗口大小。

计算haploPS、XP-EHH、 Fst，正向选择分析方法寻找性状相关的位点（拿几个群体的重测序数据，轻松发核心中文或者<3的SCIE）

π，核苷酸多样性，越大说明核苷酸多样性越高，越低说明两个座位DNA序列差异越小。

vcftools

计算和可视化， 参考

找到重测序的数据，基因分型，找到单倍型，call SNP,过滤，注释snp,可视化，分别计算haploPS,XP-EHH,Fst求交集，公共基因进行注释，富集分析。

https://wwwjianshucom/p/6e6d54d7483e

https://wwwgenedenovocom/news/364html

LDSC的安装使用

vcftools --vcf F2_3vcf --plink --out F2_3 #把vcf格式转为plink格式

1、切断电源。

2、拆头：把电风扇的保护网拆下来。在保护网的四周有卡，松开卡后，拧开螺丝，就能拿下保护网了。

3、拆风扇叶子：把扇叶正面中间的圆塑料盖把它拧下来后就会看到露出的一小节轴，拿住叶子用小锤轻轻敲击轴扇叶就拿掉了。

4、拆立管：上方有个螺丝，宁松，然后整个上身可以取下来。

5、拆脚盘：底部有个大螺丝，宁松，管子就可以从脚盘上取下来。

注意事项：在拆风扇的时候一般不要触碰到定时器，更加不要拆定时器。因为电风扇等用的定时器因为在生产厂家生产时，是用专用的设备或者工具装配起来的，自己家里一般不太可能有这些专用工具，而定时器一旦拆解，再要复装的话，里面的发条、齿轮等很难定位和安装，所以一般拆解后就很难复原。

扩展资料

注意事项

炎热夏季，打开电扇，清风拂面，好不惬意，可因使用电风扇不当而得病的人也不少，究其原因，是因为不少人缺乏使用电风扇的常识。

电风扇是许多人夏季主要的防暑降温用具。但有人使用电风扇方法不当，给健康带来危害，发生感冒、面神经麻痹、肩周炎、腰酸背痛等症。

吹电风扇的五个伤身误区

1、长久吹

很多人喜欢长时间吹电风扇，觉得刚刚吹凉了身体就停止，会觉得身上还热，不如长时间吹着舒服。可是，长时间对着电风扇吹，人体温度会随着汗液的大量蒸发而下降，容易引起伤风、感冒、腹痛、腹泻等疾病。一般以一次吹风半小时到1小时为宜。

2、快速吹

有人为了尽快凉爽起来，便把电风扇开到最快速，认为风大过瘾解热。这是不当的做法。当气温超过30℃时，空气温度已接近于人的正常体温，电风扇吹来的风，也是高温风，此时人体的热量主要应靠汗液蒸发散热。

如果电扇风吹得过大，皮肤表面温度下降，毛孔闭塞，身体内部汗液散发不出来，还会感到炎热，同时还会出现疲乏无力、腰酸背痛，这就是"憋汗"。因此，不宜用电风扇高档高速吹风，应当调到中速或低速，吹温柔的阵阵微风为好。

3、吹近风

电风扇吹风不宜放在离身体很近的地方，如果近处吹强风，且只吹身体的一面，使受风面的皮肤汗液蒸发快，温度显著降低。

而吹不着风的一面，汗液蒸发慢，致使身体两面的血液循环和汗液排泄差距过大，神经中枢就会失去平衡，一旦时间过久，各器官就会疲惫不堪，从而感到全身不适。因此，在吹电风扇时，最好与人的距离在2米以外，使吹的风均匀柔和。

4、吹定向风

的电风扇，多是摇头扇，吹风时电扇不断移动位置和方向，吹风形成一阵大一阵小，使体表受风缓慢些，不会使人感到太凉，感到全身温度均匀。所以，最好用摇头扇，不要吹定向风。

5、睡着吹

即是用电风扇降温伴睡。人在熟睡时机体各脏器的功能降到最低水平，一切反射消失，免疫力下降，易招致疾病。

变频器控制面板上的电位器，一般是用来调整变频器的输出频率的，顺时针旋转，可以增加变频器的输出频率/电机转速，逆时针旋转，可以降低变频器的输出频率/电机转速。如果旋转电位器不起作用，那就需要设定变频器参数中的“频率指令来源”这类的参数，将其设置为“控制面板电位器有效”，才能用来改变变频器的输出频率/电机转速。

一、变频器调速的方式

变频调速的方式有好几种，变频调速的主要方法是我们给变频器设置频率指令，这种频率指令的设置最常用的一般可以通过变频器的操作面板给定频率指令、脉冲信号给定、0到10V的电压模拟信号给定或者0到24毫安模拟电流信号给定、通信方式给定和接点信号给定等。

变频器

二、变频调速的基本原理

变频调速的基本理论依据是根据n=60f/p,在这个公式中我们只要改变电源的频率，电动机定子的旋转磁场转速就会改变，从而使电动机定子的转速也跟着变化。这样就达到了调速的目的。所以我们可以把变频器看作是一个改变电动机电源频率的设备。在这个变频器中，首先它把我们工频50HZ的交流电转换成直流电，然后再通过变频器中的逆变环节把直流电改变成频率和电压都可以调节的交流电，然后供给三相异步电动机。电动机根据我们所设定的频率大小实现转速的调节，从而可以在非常宽的频率范围内达到无级调速的目的。

，全称为fixation index，是一种用于衡量 群体间分化程度 的统计检验量（由Wright's F-statistics衍生而来）。 一般从SNP或microsatellites数据计算得到，且一般用在群体遗传学分析中。

每一个Pop对应的基因型（genotype | genotyped individuals）数量为：

每一个Pop的等位基因数量（the number of allele）为：

这边是biallelic类型（A or a），因此等位基因数量为基因型数量的2倍。

Pop1中，

Pop2中，

Pop3中，

标注期望，即服从HD平衡理论，可以看看北京大学生物演化课程

Pop1中，

因此，Pop1中对应的基因型数量均无偏差。

Pop2中，

对应基因型数量的差值为+725, -155, +775。

Pop3中，

对应基因型数量的差值为-225, +45, -225。

Pop1为05，Pop2为03，Pop3为05

公式标注

Pop1为05，Pop2为0455，Pop3为0455

公式标注

，即04156

，即05844

1首先使用 计算

，带入数值，即04875

2使用H_{exp}计算H_{S}

，带入数值，即04691

3计算global heterozygosity indicex的期望值

，即04845

1计算 ，即-00393

2计算 ，即00344

3计算 ，即-00036

群体间分化的程度达到了34%

标注只适用于二倍体。

在对两个群体之间进行不同区段的 计算之后，需要判断哪一些区段，是“真正”受到了选择压力，根据近期看的文章，得到可以选择前5%的作 为一个阈值，对区域进行划分，高于该阈值的被认为受到了选择压力的影响，进一步就可以得到是受到影响的是哪些SNP，最终即可得到受到影响的是哪些gene。

当然，对 的计算结果可视化，当然也是非常重要的一部分，但是这篇文章主要想写的是计算原理以及如何使用vcftools进行计算。

[1] https://enwikipediaorg/wiki/Fixation_index

[2] http://wwwuwyoedu/dbmcd/popecol/maylects/fsthtml

[3] The genome of oil-Camellia and population genomics analysis provide insights into seed oil domestication

futurebass未来的低音bass[英][bes][美][bes]n低音歌唱家，低音乐器;[鱼]欧洲鲈鱼;[植]椴树，椴属树木，美洲椴木;adj低音的;复数：basses例句:1Mrbassthinksthatclothes-shoppingontabletdeviceswillbethenextbig

1、首先要确定手机是否刷入了Recovery ，如果没有的需要刷入Recovery才能进入Recovery进行刷机。 2、然后进入设置把USB调试关闭掉，把刷机包复制到SD卡里面。关闭了USB调试才能 读取出手机内存。 3、然后进入recovery 式之后先清除所有的数据。 4、然后清除手机 里面的缓存数据，这些操作上下就可以使用音量键 调节。确定就是开机键。 5、然后选择刷机包是ZIP文件，点击从SD卡上面选择ZIP文件。然后选择刷机包的文件点击确定即可。 7、刷机成功之后会有成功的提示，然后返回重启系统即可进入刷的新系 统里面了 。