我想问，《数码宝贝》里，素那和阿和最后有没有在一起？

已经在一起了。
以下是官方说法。

就是这个，你们自己看看
后日谈について
前作では恋爱要素は皆无に等しかったが、今作では恋爱要素も盛り込まれている。しかし、伏线などはハッキリしておらず、话の流れに関系する部分はない。特に38话でヤマトと空が恋人になった事が判明した时は、当の空役を演じる水谷优子も自身のラジオ番组で「太一と结ばれる物とばかり思ってたので残念」と语るほどであった。
上记の様に作品内で唐突ながらもカップルが诞生したにも関わらず、最终话でナレーションで结婚したと说明されたのは、それまでに恋爱要素は无く、结婚した理由が「声优同士の仲が良かったから」と02DVD-BOXブックレットで说明されている贤と京のみであり、ヤマトと空の结婚については触れられず、说明不足による混乱も引き起こされた。
また、関弘美プロデューサーが2002年にVジャンプにゲストとして登场した际の质问の回答にて、タケルとヒカリも恋人にはならず、结婚もしてないと発言した。この事について、発言を撤回させる为の活动がネット上で起きた事もある。この时、ヤマトと空が结婚した事にも钉を刺されている。[1]
反面「作品内でカップルにならなくても结婚していることはありうる」「结婚について最终回で语られなかったから结婚してないとは限らない」「后に作品外でハッキリと否定されたのは一组だけで、他は未确定状态で放置された」という状况も生まれ、未来の彼らについての、不确定な、ファンの想像の余地のある部分も结果的に生まれたとも言える。

还有官方特地交待的
注釈

^ タケルとヒカリの仲の良さはファンの间でも人気があり、公式サイトのランキングコーナー「あなたが选ぶベストコンビ」で1位になるほどだった。2位が太一と空であり、1位と2位のペアが両方ともハッキリと否定された事となった。

这个是翻译。
前作虽然基本上没有恋爱要素，但本作却是恋爱要素满载。不过，伏笔之类却没有明确表现出来，故事情节发展相关的部分也没有。特别是38话，当大和跟空的恋人关系明确的时候，当时饰演空的水谷优子也在自己的广播节目中说出了“感觉很可惜，自己一直都认为会和太一结合”之类的话。上面所说的作品内，与唐突的产生情侣无关，最终话的旁白说明结婚的原因，也没有这样的恋爱要素，不过结婚的理由却是“声优们关系很好”，这只是02DVD- BOX的Booklet上说明的贤和京的关系，并没有涉及到大和跟空为什么会结婚之类的，这样说明不足引起了混乱。
再者，很据制作人关弘美在2002年的V-JUMP上作为嘉宾的时候回答的问题所说，武和光没成为恋人，最后也没有结婚。就此事，在网络上也有要求撤回此言的事件发生。此时，大和跟空的结婚也就作为一个刺激点。[1]"也有作品内虽然不是情侣但最后却结了婚的可能性“，”最终话没说结婚但就不能说最后就没有结婚“,"后续作品外也只有一组作品对此做出了否定，其他作品都是未置可否状态”，这样说来，他们未来会怎样，fan们拥有想象的余地的那一部分有可能也会产生那样的结果。